معصومه ابتکار از هشدار این سازمان در خصوص خشک شدن دریاچه اورمیه خبر داد. یعنی آن زمان که او خود برای بار اول رئیس این سازمان بود. رییس سازمان حفاظت محیط زیست کشور در تازه ترین اظهارات خود درباره دریاچه اورمیه گفت : تلاش های زیادی در حال انجام است تا این دریاچه احیا شود. اما احیای دریاچه اورمیه زمانبر است و تصمیمی که گرفته شده این است که در ابتدا حق آبه های طبیعی را بدهیم و بعد به بخش های دیگر توزیع شود.

وی همچنین درجمع دانشجویان به پیش بینی اعتبار ۷۵۰ میلیاردی برای نجات دریاچه و گسترش ارضی فعالیت های کشاورزی ناپایدار در اورمیه اشاره کرد.رییس سازمان حفظت محیط زیست گفت: سازمان حفاظت محیط زیست از سال ۷۹ نسبت به خشک شدن دریاچه اورمیه هشدار داده بود اما متاسفانه با فشارهای فراوان به دولت به انحاء مختلفی مانند خواسته های نمایندگان مجلس، احداث سدهای متعدد و حفر چاههای غیرمجاز، همچنین تغییر الگوی کشاورزی توسط مردم به کشاورزی آب بر اتفاقی که نباید رخ دهد رخ داد. به گفته وی جاده میان گذر نیز یکی از اقداماتی بود که به خشک کردن بیشتر آب این دریاچه کمک کرد.